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南通市第一人民医院胃肠外科系南通市医学重点学科，市级重点专科单位。 2021年年度国家手术部位感染监测网培育基地，江苏省医学会外科分会外科感染及危重症副主委单位，江苏胃癌联盟成员单位，长三角区域结直肠外科协助单位。
专科有医护人员34名，其中主任医师2名，副主任医师1名，硕导2名，博士7名，硕士7名；市重点学科学科带头人1名、南通市医学重点人才1名、青年医学人才1名、市“226”高层次人才培养对象1名；国家级委员1名，省级委员2名，市级委员3名。
科室注重胃肠道肿瘤治疗的规范化及微创化，以多学科诊疗(MDT)理念制定精准化、个体化的肿瘤治疗方案，是江苏省率先开展腹腔镜胃肠肿瘤根治术的单位之一。已连续九年在全国范围内开展手术直播和手术演示。近年来，科室在全腹腔镜胃癌消化道重建方面常规开展：双通道、单肌瓣，Roux-en-Y等重建；结直肠癌方面：腹腔镜超低位直肠癌保肛术、腹腔镜乙状结肠癌保留直肠上动脉+左结肠动脉的“双超选动脉保留术”，以及腹腔镜下后腹膜肿瘤切除等在省内均处于较高水平。
科室拥有3D腹腔镜系统、电子胃肠镜系统、超声高频外科集成系统等先进仪器设备，同时专科服务设备包括Force CT (急诊 24小时)、磁共振系统3.0T及1.5T、SPECT-CT、临床医学中心设备、单光子发射计算机断层成像及计算机扫描系统等。具有较强的医疗服务能力，确保年手术量1700台次以上。
近年来，科室获国家自然科学基金项目1项，江苏省卫健委立项2项，市级课题立项等10项；获江苏省省医学新技术引进奖二等奖2项、江苏医学科技奖三等奖1项，市新技术引进一等奖1项，市新技术引进三等奖3项；发明专利1项、实用新型专利12项，在省级以上及核心刊物、 SCI 期刊发表文章30余篇，其中最大影响因子13.6分。常规每年定期举办国家级和省级医学继续教育培训项目。
科室是南京医科大学、南通大学普外科硕士学位授予点，及国家级住院医师规范化培训基地，拥有硕士生导师2名，每年为国家培养2名优秀研究生。
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