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南通市第一人民医院康复医学科前身可追溯到1976年成立的理疗科，是区域内较早独立设置的理疗科。康复医学科创建于2011年9月，现设置床位46张，总面积近2000平方米，其中康复治疗中心面积达1200平方米，设备总价1000万以上。
科室是国家级住院医师规范化培训基地、国家药物/器械临床试验基地、中国康复医学会科普教育基地、江苏省紧缺人才培训基地，南通市工伤康复协议单位，南通市康复医学临床医学中心、市级神经损伤康复临床医学研究中心、市级临床重点专科，中国康复医学会医康融合工作委员会副主委单位、社区康复工作委员会副主委单位、青年工作委员会副主委单位、江苏省康复医学会副会长单位、江苏省医学会物理医学与康复学分会副主委单位、江苏省医师协会康复医师分会候任主委单位、江苏省康复医学专科联盟副理事长单位、南通市康复医学会会长单位。
康复医学科现有医技护人员46人，其中医师15人，康复治疗师16人，专职科研人员2人；主任医师2人、副主任医师2人，博士生导师1人、硕士生导师2人，博士4人、硕士21人，省级人才称号1人，市级高层次人才3人；3人次获中国康复医学会“优秀康复医师”、“优秀青年康复医师”、“科普先进个人”，2人次获省“优秀科技工作者”称号。
科室目前分为重症康复、神经康复、骨关节康复、心肺康复、疼痛康复、运动康复、儿童康复、盆底康复和传统医学康复等九个亚专业方向，病种涵盖脑卒中、颅脑外伤与肿瘤、脊髓损伤、多发性损伤、脑瘫、进行性脊肌萎缩症（SMA）、骨关节损伤以及各类药物治疗效果不佳的各种急慢性疾病，具有处理各种疑难危重病症临床康复的能力；与各临床相关科室紧密结合，开展床旁早期康复治疗；常规开展意识障碍的多模态精准评估和综合促醒治疗、非侵入性神经调控技术、虚拟现实训练、动态平衡评估与训练、下肢康复机器人训练等特色康复技术，并充分继承和发扬针灸、推拿、中药外敷及中药熏蒸等传统中医康复，形成了自己的特色与优势，已达省内先进水平。
科室目前康复治疗设备主要有：上肢智能运动训练系统、下肢康复机器人、等速肌力训练系统、悬吊训练系统、站立平衡评定与训练系统、听觉言语语言检查检测处理系统、经颅磁刺激治疗仪、高精度经颅直流电刺激仪、近红外脑功能成像仪、脑机接口、外骨骼下肢机器人、迷走神经电刺激仪、激光磁治疗仪、美国Vitalstim吞咽治疗仪、脑循环系统治疗仪、数字化认知训练系统、镜像神经元训练仪、生物反馈仪、痉挛肌治疗仪、膈肌起搏仪、冲击波治疗仪、威伐光、肺功能评测仪、膀胱超声等。
近5年来，科室发表SCI论文36篇、中华核心期刊论文8篇、其他核心期刊论文37篇，主编专著4本、参编5本，牵头制定地方标准1项，形成专家共识1项；主持国家重点研发子项目2项，国家和省自然基金5项及其他省级课题6项、市级课题25项，累计科研经费500余万元；获中国康复医学会科学技术奖2项、省医学科技奖1项、省医学引进新技术奖3项、市科学进步奖2项、市医学引进新技术奖11项、市自然科学优秀学术论文奖2项，发明专利4项，成功转化2项，多人在国家级、省级会议上获奖。
科室承担中国科学院苏州医工所和扬州大学博士研究生、南通大学康复医学与理疗学博硕士研究生培养以及南通理工学院康复治疗学本科专业课程教学任务，目前联合培养在站博士后1人，在读研究生9人（国际留学生1人）。
科室作为基层特色科室市级孵化中心之一和农村区域性医疗卫生中心康复疼痛诊疗中心培训基地，每年均开办省级、市级（区域级）培训项目。近5年主办国家和省级继续教育项目9项，市级继续教育项目7项。
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