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南通市第一人民医院病理科创建于1977年。是江苏省临床重点专科、国家级病理住院医师规范化培训基地、江苏省病理科专科联盟常务理事单位、南通市临床重点专科、南通市重点学科、南通市医学创新团队，是集医疗、教学和科研为一体的综合性病理科。科室面积1800M2，分设病理诊断室、分子病理室、免疫荧光室、数字切片与病理远程会诊室、免疫组化室、病理组织库、取材室、冰冻制片室、病理技术室、细胞制样室、病理档案室等。
现有工作人员29名：主任医师4人，副主任医师1人，副主任技师1人，主治医师/主管技师5人，住院医师/技师16人。人员学历层次高，有硕士17名。主要工作人员分别经过复旦大学附属肿瘤医院、南京军区总医院、江苏省人民医院、台北荣总医院、日本成田纪念病院等单位进修培训。
病理科目前常规开展的主要技术项目涵盖了三级甲等综合医院省级重点专科的所有达标项目。在南通及周边地区同类学科中技术力量强，有多项技术项目填补了省内和本地区空白。病理科分子实验室获江苏省临检中心肿瘤基因检测实验室认证，EGFR、ALK1、ROS1、KRAS、NRAS、BRAF等基因突变检测和FISH-Her2基因扩增检测获国家病理质控中心（PQCC）和江苏省病理质控中心认证，并开展一代测序和荧光原位杂交检测，肺癌9基因、结直肠癌多基因、宫内膜癌分子分型、微卫星不稳定性、肿瘤基因甲基化检测等为肿瘤早期诊断和肿瘤分子靶向治疗提供精准数据；免疫组化实验室开展200多种免疫组化抗体检查，多年来顺利通过PQCC、中国医疗器械行业协会病理专业委员会（CCPI）和江苏省病理质控中心的室间质评和质量认证证书。
目前，病理科常规开展的优势和特色技术项目有：上消化道早癌ESD手术效果病理规范评估与诊断，ProExC、P16在宫颈上皮病变诊断中的应用，甲状腺穿刺细胞学BRAFV600E基因突变检测，胃肠间质瘤病理诊断与预后的形态学评估，肿瘤抑制基因CADAM1mRNA在食管鳞癌侵袭转移中的调控研究，胃癌组织芯片技术与多基因表达研究等。
OlympusBX53荧光显微镜，LeicaDM多头显微镜，3D数字扫描显微镜，BenchMark ULTRA/ XT全自动免疫组化染色仪，SAKURA全自动染色封片机，SAKURA和Leica1950冰冻切片机，ABI7500实时荧光PCR仪，阅微GenReader基因测序仪，Genlution全自动核酸提取仪，自动组织脱水机，原位杂交仪，海尔超低温冰箱，病理图像分析系统等。
科室人员先后发表学术论文80多篇，参编专著4本。近年在国际SCI专业期刊和《中华病理学杂志》《中华消化杂志》《中华肿瘤杂志》等专业核心期刊上发表论文20多篇。“新病理形态学评估方案在胃肠间质瘤诊断中的应用”“ProEXC、P16和Ki-67在宫颈上皮病变诊断中的应用”获江苏省卫生厅医学新技术引进二等奖和南通市卫生局优秀新技术项目一等奖。“胃癌组织芯片中生存素等多基因表达的研究”获南通市科技进步二等奖和南通市卫生局优秀新技术项目一等奖，“宫颈癌缺氧诱导因子表达和微血管密度的研究”和“食道癌中CD105及Cyclin D1表达及意义”“ProExC、P16INK4A和Ki-67在宫颈癌前病变的表达与临床价值研究”“基因ADAM17mRNA、EGFR在食管鳞癌发生、发展中的作用机制及预后评估中的应用价值”分获2009年、2011年、2015年、2016年南通市科技进步三等奖。另外有多项技术获南通市卫生局优秀新技术项目一、二、三等奖多项。近年获省333人才课题和南通市科技局立项课题10多项。
承担多所医学院校的教学工作和下级医院业务培训工作，2015年成为国家级病理住院医师规范化培训基地。近年来培养十多名南通大学病理专硕研究生，接受县级医院病理住院医师规范化培训和病理专业人员进修十多名，带教南通大学病理学本科、公卫、杏林和苏州卫校、体臣卫校检验与病理技术大专班。
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